在食用菌生產中，如接種車間的環境衛生差，則空氣中的雜菌會汙染食用菌菌種
，將嚴重影響接種成功率及日後食用菌的質量和產量。
在接種環節，汙染食用菌菌種的雜菌很多
，包括細菌、黴菌、酵母菌、放線菌等。菌種遭受微生物汙染的原因主要有以下幾方麵——

1.菌種培養室陰暗潮濕、空氣汙濁
，空氣中含很多雜菌
，汙染了食用菌菌種。

2.接種室消毒不嚴。未采用合適的方法

，對接種室進行有效的殺菌消毒。

3.培養料滅菌不徹底，被雜菌汙染。滅菌不徹底的原因主要有：1）滅菌操作不當。采用常壓100℃、6-8小時或高壓121℃、0.5-2小時的滅菌方法
，均能殺死一般雜菌的菌絲體與孢子。目前
，食用菌培養料多采用常壓滅菌或高壓滅菌方法。常壓滅菌對穀粒、糞草等材料的滅菌難度較大，不容易達到完全滅菌的效果；而高壓滅菌法的效果更好。2）培養料的不同。製作菌種所需材料的種類
、培養料的含菌量
、含水量以及酸堿度等因素都會影響滅菌效果。應根據不同培養料的特性，選擇相應的滅菌時間。3）菌種包裝容器的影響。製種時，一般用瓶或袋包裝菌種。塑料袋傳熱速度快，而玻璃瓶傳熱速度則慢些。在相同培養料
、使用相同的滅菌方法時，瓶裝料要比袋裝料滅菌時間更長。

4.菌(jun)種(zhong)中(zhong)含(han)有(you)雜(za)菌(jun)。用(yong)於(yu)擴(kuo)大(da)培(pei)養(yang)的(de)食(shi)用(yong)菌(jun)菌(jun)種(zhong)的(de)原(yuan)種(zhong)本(ben)身(shen)必(bi)須(xu)是(shi)純(chun)菌(jun)，這(zhe)樣(yang)才(cai)能(neng)保(bao)證(zheng)菌(jun)種(zhong)的(de)單(dan)一(yi)性(xing)。如(ru)果(guo)食(shi)用(yong)菌(jun)菌(jun)種(zhong)中(zhong)含(han)有(you)雜(za)菌(jun)，則(ze)會(hui)導(dao)致(zhi)接(jie)種(zhong)率(lv)下(xia)降(jiang)。

5.jiezhongrenyuancaozuobudang。shiyongjunjiezhongguochengxuyaoyangedewujuncaozuohuanjing，rucaozuobuguifan，zeyidaozhipeiyangliaobeizajunwuran。wuranpeiyangliaodezajunyibanshijiezhongshikongqizhongdezajun

、菌袋表麵的雜菌以及接種人員的體表雜菌等。