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隻有對食品生產車間內的空氣進行嚴格控製消毒，車間內空氣中的微生物含量才能得到有效控製，來杜絕產品的汙染，導致產品發黴。
一、化學劑熏蒸消毒
熏蒸消毒是利用消毒藥物氣體或煙霧，在密閉空間內進行熏蒸達到消毒目的。該方法既可用於處理室內空氣（汙染的空氣），亦可用於處理汙染的表麵。食品生產經營場所應定期實施熏蒸消毒，以保證生產場所及空氣的清潔。
熏蒸的產品現使用較多的（甲醛，高錳酸鉀，過氧乙酸，二氧化氯），提醒食品企業請勿使用甲醛，高錳酸鉀來熏蒸。
現為什麼不建議食品企業使用甲醛熏蒸法來對車間空氣消毒
1.消毒滅菌作用時間長，影響生產。如甲醛熏蒸：消毒時間12h，靜置4 h，排風8h，消毒一次至少需要24 h。消毒一次要停產2~5天。
2.為了排除刺激性氣味，消毒滅菌後長時間開啟通風係統，非生產運行時間過長，能源浪費大。
3.需要設置排風係統或設施。
4.易產生二次汙染。如甲醛熏蒸會出現多聚甲醛聚合物（白色粉末），附fu作zuo在zai潔jie淨jing室shi內nei的de維wei護hu結jie構gou和he設she備bei管guan道dao表biao麵mian上shang，在zai消xiao毒du後hou幾ji天tian內nei，其qi懸xuan浮fu離li子zi數shu會hui增zeng加jia，甲jia醛quan聚ju合he物wu也ye逐zhu漸jian解jie聚ju成cheng甲jia醛quan，對dui生sheng產chan操cao作zuo人ren員yuan危wei害hai很hen大da。
5.消毒間隔時間長由於每次化學試劑熏蒸消毒滅菌時間至少需24小時，不能天天進行，因此目前各生產廠家大多采用每月一次大消毒，而微生物汙染源――人、物、料、室外新鮮空氣等卻天天要進出車間，其帶入的微生物不能得到及時殺滅，會出現微生物隨時間延長而增加的現象。
6.有強烈的刺激性氣味，消毒滅菌後長時間滯留在室內環境中，去除殘留氣味時間長，對生產操作人員身體有害，有致癌作用。
7、有存在食品安全的隱患。
二、臭氧消毒
chouyangdehuaxuexingneng，sanyangyuanzidebuwending，yifenjietexing，juedingleqiyanghuanengliheshajunnenglihenqiang，duibingduxijundengweishengwushamielvjiaogao，yinci，chouyangshiyizhongmiejunji。
廣譜性臭氧在空氣中的濃度達到2~15ppm時，對細菌病毒等微生物的內部結構有較強的氧化破壞性，因此，他和甲醛、環氧乙烷、過氧乙酸等化學試劑均屬於廣譜性滅菌劑。
環保性（或稱潔淨性）臭氧的半衰期為20分鍾左右，臭氧在氧化消毒滅菌後，多餘的氧原子在30~40分鍾後，又結合成氧分子，不產生任何毒留殘物，不存在滅菌後的二次汙染問題；同時，增加了室內空氣含氧量，還具有很強的除黴、醒、臭chou等deng有you機ji物wu異yi味wei的de功gong能neng，對dui中zhong藥yao材cai及ji其qi他ta原yuan輔fu料liao的de防fang黴mei防fang蟲chong蛀zhu等deng有you明ming顯xian的de作zuo用yong，改gai善shan了le潔jie淨jing室shi內nei空kong氣qi環huan境jing品pin質zhi，因yin而er被bei稱cheng為wei潔jie淨jing消xiao毒du劑ji。
由於臭氧是廣譜滅菌劑，在一定濃度下，在相對密閉的環境下，擴散均勻，隻需30~60分鍾，就可以將潔淨室內的細菌殺滅，克服了紫外線滅菌存在諸多死角的缺點，可達到全方位的消毒滅菌目的。
經濟性把臭氧通入空調係統進行循環消毒，對空氣淨化設備、過濾係統、介質過濾材料具有防黴變、防(fang)堵(du)塞(sai)的(de)效(xiao)果(guo)，可(ke)以(yi)減(jian)少(shao)空(kong)氣(qi)中(zhong)懸(xuan)浮(fu)的(de)氣(qi)溶(rong)膠(jiao)顆(ke)粒(li)，提(ti)高(gao)空(kong)氣(qi)的(de)潔(jie)淨(jing)度(du)，延(yan)長(chang)淨(jing)化(hua)設(she)備(bei)使(shi)用(yong)壽(shou)命(ming)，降(jiang)低(di)運(yun)行(xing)成(cheng)本(ben)，這(zhe)是(shi)其(qi)他(ta)方(fang)法(fa)所(suo)做(zuo)不(bu)到(dao)的(de)。同(tong)時(shi)，因(yin)為(wei)臭(chou)氧(yang)消(xiao)毒(du)後(hou)不(bu)產(chan)生(sheng)二(er)次(ci)汙(wu)染(ran)問(wen)題(ti)，不(bu)需(xu)要(yao)設(she)置(zhi)排(pai)風(feng)措(cuo)施(shi)進(jin)行(xing)二(er)次(ci)清(qing)潔(jie)，降(jiang)低(di)了(le)空(kong)調(tiao)設(she)施(shi)的(de)初(chu)投(tou)資(zi)，不(bu)需(xu)要(yao)設(she)置(zhi)值(zhi)班(ban)風(feng)機(ji)，節(jie)省(sheng)了(le)運(yun)行(xing)費(fei)用(yong)。
操cao作zuo簡jian單dan消xiao毒du時shi，直zhi接jie將jiang臭chou氧yang通tong入ru潔jie淨jing室shi或huo空kong調tiao係xi統tong中zhong，根gen據ju潔jie淨jing室shi的de特te點dian，確que定ding消xiao毒du時shi間jian，設she定ding好hao定ding時shi器qi，消xiao毒du結jie束shu後hou自zi動dong關guan機ji，操cao作zuo使shi用yong特te別bie簡jian單dan。
運行時間短使用臭氧消毒時，消毒時間一般在30~60分鍾，消毒後，多餘的氧原子在30分鍾後，又結合成氧分子，前後總計隻需60~90分鍾即可完成一次消毒，既省時又安全。
三、二氧化氯消毒
優點：
第四代含氯而非氯製劑的過氧化物類消毒劑；
以分子形式存在，氧化殺菌，不生成氯仿等有機鹵代物；
無抗藥性；
殺滅範圍廣，對細菌、真菌、病毒、芽孢、艾滋、乙肝等都有很好的抑製和殺滅效果；
不受溫濕度、PH值等因素影響；
可根據不同對象來稀釋成不同使用濃度；
可采用噴霧、浸泡、擦拭、熏蒸、噴淋等方法；
可用於食品生產的人員、設備、器具、空間環境、生產用水等；
缺點：
有點類似於氯氣的刺鼻性氣味；
有一個活化的環節。
