GMP是食品加工企業必須達到的基本條件；SSOP是企業為達到GMP要求而製定的在食品生產加工有關過程中實施清洗
、消毒和保持衛生的作業指導文件
；GMP是政府有關部門製定的強製性規定；SSOP是企業內部的管理文件。GMP的規定是原則性的；SSOP的規定是具體的。GMP是製定SSOP計劃的依據，是SSOP的法律基礎

；SSOP是落實GMP的要求，指導衛生操作管理具體實施“作業指導書”。GMP的目的是保證生產出符合安全衛生要求的食品；SSOP的目的是使企業達到GMP的要求。