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1、超淨工作台
微生物的培養都是在特定培養基中進行無菌培養，那ô無菌培養必然需要超淨工作台提供一個無菌的工作環境。
2、培養箱
培養箱有多種類型，它的作用在於為微生物的生長提供一個適宜的環境。生化培養箱隻能控製溫度，可作為一般細菌的平板培養;ù菌培養箱可以控製溫度和濕度，可作為ù菌的培養;CO2培養箱適用於厭氧微生物的培養。
3、天平
天平用於精確稱量各類試劑。實驗室常用的是電子天平，電子天平按照精度不同有不同的級別。
4、微生物均質器
用於從固體樣品中提取細菌。用微生物均質器製備微生物檢測樣本具有樣品無汙染、無損傷、不升溫、不需要滅菌處理，不需洗刷器皿等特點，是微生物實驗中使用較為方便的儀器。
5、菌落計數器
菌(jun)落(luo)計(ji)數(shu)儀(yi)可(ke)協(xie)助(zhu)操(cao)作(zuo)者(zhe)計(ji)數(shu)菌(jun)落(luo)數(shu)量(liang)。通(tong)過(guo)放(fang)大(da)，拍(pai)照(zhao)，計(ji)數(shu)等(deng)方(fang)式(shi)準(zhun)確(que)的(de)獲(huo)取(qu)菌(jun)落(luo)的(de)數(shu)量(liang)。有(you)些(xie)高(gao)性(xing)能(neng)的(de)菌(jun)落(luo)計(ji)數(shu)器(qi)還(hai)可(ke)連(lian)接(jie)電(dian)腦(nao)完(wan)成(cheng)自(zi)動(dong)計(ji)數(shu)的(de)操(cao)作(zuo)。
6、微波¯/電¯
用於溶液的快速加熱，微生物固體培養基的加熱溶化。
7、高壓滅菌鍋
微生物學所用到的大部分實驗物品、試劑、培養基都應嚴格消毒滅菌。滅菌鍋也有不同大小型號，有些是手動的，有些是全自動的。用戶需要根據自己的需要選購。
8、移液器
液體量器用於精密量取各類液體。常見的液體量器有量筒、移液管、微量取液器、刻度試管、燒杯。
9、低溫冰箱
冰箱是實驗室保存試劑和樣品必不可少的儀器。微生物學實驗中用到的試劑有些要求是4度保存，有些要求是負20度保存，實驗人員一定要看清試劑的保存條件，放置在恰當的溫度下保存。
10、生物安全櫃
微生物實驗中涉及的試劑和樣品微生物有些是有毒的，對於操作人員來說傷害較大。為了防止有害懸浮微粒、氣溶膠的擴散，可以利用生物安全櫃對操作人員、樣品及樣品間交叉感染和環境提供安全保護。
11、搖床
搖床是實驗室常用的一種儀器，在微生物實驗操作過程中，液體培養基培養細菌時需要在特定溫度下振蕩使用。
12、純水裝置
純水裝置包括蒸餾水器和純水機。蒸餾水器的價格便宜，但在造水過程中需要有人值守;純水機價格高些，但是使用方便，可以儲存一定量的純水。純水使用也有不同的級別，實驗中配製試劑，配製培養基均需用純水。
13、生物顯微鏡
由於微生物體積較小，所以在觀察時需要借助生物顯微鏡。生物顯微鏡用於微生物和微小物品結構，形態等的觀察。
14、冷凍幹燥機
主要適用於細菌、微生物、酵jiao母mu等deng的de幹gan燥zao。用yong於yu幹gan燥zao保bao存cun易yi脫tuo水shui的de產chan品pin，在zai加jia水shui以yi後hou能neng夠gou再zai次ci恢hui複fu原yuan材cai料liao的de特te性xing，不bu影ying響xiang其qi生sheng物wu活huo性xing等deng。通tong過guo冷leng凍dong幹gan燥zao，細xi菌jun之zhi類lei的de材cai料liao成cheng為wei幹gan燥zao狀zhuang態tai，從cong而er不bu會hui發fa生sheng化hua學xue改gai變bian。
15、分光光度計
分光光度計在微生物試驗中用於測定微生物懸液的濃度，可以正確選取合適的培養時間。一般是在600nm波長測定菌液濃度。
16、恒溫幹燥箱
恒溫幹燥箱是用於滅菌和洗滌後的物品烘幹。烘箱有不同的控溫範Χ，用戶可以根據實驗需求進行選擇。例如，有些塑料用具隻能在42-45℃的烤箱中進行烘幹，一般玻璃用具的烘幹可以選擇60℃。
17、恒溫水浴鍋
水浴鍋是一種控溫裝置，水浴控溫對於樣品來說比較快速且接觸充分。有些微生物反應需要在37度，42度，56度下水浴進行，所以恒溫水浴鍋可以提供需要的溫度。
18、酸度計
用於配置試劑時精確測量PH值，從而保證配置的溶液的精確性。有時也需要利用pH計測定樣品溶液的酸堿度。
19、離心機
用yong於yu收shou集ji微wei生sheng物wu菌jun體ti以yi及ji其qi他ta沉chen澱dian物wu。離li心xin機ji有you冷leng凍dong和he常chang溫wen之zhi分fen。有you些xie樣yang品pin由you於yu在zai常chang溫wen下xia不bu太tai穩wen定ding，需xu要yao低di溫wen環huan境jing，要yao視shi樣yang品pin的de種zhong類lei而er定ding。
20、液氮罐
液氮罐儲存液氮，可用於細菌、酵母、ù菌和大型真菌等各種微生物的長期保存。
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