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物理性質：
柱長，內徑，如250*4.6mm。一般柱長在2―250mm，柱越長，分離度越高，但柱壓更高，分離所需時間更長；但分離度與理論塔板數的平方根成正比，所以一昧增加柱長並不是最有效的分離手段，一般情況下，150mm、5um的填料可以提供足夠的塔板數。
粒徑，影響色譜分離度。粒徑越小，分離越快，柱效越高，但柱壓力越高，柱容易被汙染，導致柱壽命降低。常見分析柱通常使用5um填料，複雜的多組分樣品分離一般使用3.5umlijing，gengdaneijingdezhibeisepuzhutongchangshiyonggengdadelijing。ruguogudingxiangxuanzeshizhengque，danshifenlidubugou，namexuanyonggengxiaodelidudetianliaoshihenyouyongde。3.5um填料填充柱的柱效比相同條件下的5um填料的柱效提高近30%；然而，3.5um的色譜柱的背壓卻是5um的2倍，因此如何選擇填料粒徑需要根據現實情況而定。
孔徑，60A，120A，300A等。孔徑小，則含孔率高，比表麵積大，載碳量高；色(se)譜(pu)柱(zhu)填(tian)料(liao)孔(kong)徑(jing)大(da)小(xiao)需(xu)和(he)分(fen)子(zi)大(da)小(xiao)相(xiang)匹(pi)配(pei)，保(bao)證(zheng)分(fen)子(zi)自(zi)由(you)進(jin)出(chu)填(tian)料(liao)孔(kong)並(bing)與(yu)孔(kong)內(nei)表(biao)麵(mian)的(de)鍵(jian)合(he)相(xiang)進(jin)行(xing)分(fen)離(li)分(fen)配(pei)，通(tong)常(chang)要(yao)求(qiu)孔(kong)徑(jing)直(zhi)徑(jing)是(shi)分(fen)子(zi)直(zhi)徑(jing)的(de)3倍以上，一般小分子使用80―120A，大分子使用300A。
顆粒形狀，一般有球形和不規則形，當使用黏度較大的流動相時，球形顆粒可以降低柱壓，延長色譜柱壽命。
比表麵積，指的是每克填料的表麵積，如180m2/g―350m2/g，與粒度和含孔率有關；比表麵積大，會增加樣品與鍵合相之間的反應，增加保留和分離度；比表麵積小則可以縮短分析時間和平衡時間，並不是比表麵積大或者小就更好，需要選擇合適的比表麵積。
化學性質：
矽膠基質：最通用的基質，強度大，化學修飾容易，但使用的pH值範圍有限（一般為2―8，特殊修飾的可以達到1―12）。
聚合物基質：多為聚苯乙烯―二乙烯基苯或聚甲基丙烯酸脂，化學穩定，應用pH範圍寬，具有更強的疏水性，對蛋白質等樣品分離效果較好；但強度較小，有機溶劑可能導致聚合物溶脹而受損，批次重複性較差，商品化色譜柱不多，一般價格較貴。
載碳量：基質表麵鍵合相的比例，載碳量高，則保留增加，適合分析非極性化合物。
鍵合相：鍵合試劑不同，對化合物的選擇性不同，一般長鏈的烷基鍵合相（C18 C8）比短鏈的（C4 C3）穩定；非極性的鍵合相比極性的鍵合相（-NH2）穩定。
封端：用yong短duan鏈lian將jiang裸luo露lu的de矽gui羥qiang基ji鍵jian合he後hou封feng閉bi起qi來lai，以yi減jian少shao殘can留liu的de矽gui醇chun基ji，減jian輕qing待dai測ce組zu分fen與yu酸suan性xing矽gui羥qiang基ji反fan應ying而er引yin起qi的de色se譜pu峰feng拖tuo尾wei現xian象xiang。尤you其qi對dui於yu極ji性xing樣yang品pin而er言yan，未wei封feng端duan處chu理li的de色se譜pu柱zhu分fen離li效xiao果guo較jiao差cha。
目前市場上主要以反相色譜為主，約占80%的比例。
固定相極性
流動相極性
出峰順序
反相吸附色譜
非極性
強極性（水、甲醇、乙腈等）
強極性物質先出峰
正相吸附色譜
極性
弱極性（己烷、庚烷等）
弱極性物質先出峰
柱長及內徑的選擇：
長度的選擇：柱越長，總柱效越高(n值越大)，柱越長，分析時間也越長。250―300mm是最普遍的柱長，實驗室一半以上的工作都是采用此規格柱子，一般用來分離l0到50個組份的中等至複雜混合物；500―600mm，要求較高分辨率的應用，―般用來分離大於50個組份或包含有難分離物質的複雜樣品程序升溫分析。
內徑：柱zhu效xiao率lv與yu柱zhu半ban徑jing平ping方fang成cheng反fan比bi，內nei徑jing越yue小xiao柱zhu效xiao越yue高gao，但dan內nei徑jing越yue大da，柱zhu容rong量liang也ye增zeng加jia，允yun許xu進jin樣yang量liang就jiu越yue多duo。當dang進jin樣yang量liang超chao過guo柱zhu容rong量liang時shi，則ze因yin柱zhu內nei每mei塊kuai理li論lun板ban內nei不bu能neng建jian立li真zhen正zheng的de平ping衡heng，將jiang會hui導dao致zhi色se譜pu蜂feng畸ji變bian，柱zhu分fen辨bian率lv降jiang低di，重zhong現xian性xing不bu好hao。因yin此ci對dui於yu複fu雜za樣yang品pin需xu要yao精jing確que分fen離li，必bi須xu使shi用yong小xiao內nei徑jing柱zhu子zi。另ling一yi方fang麵mian若ruo樣yang品pin中zhong存cun在zai具ju有you很hen不bu相xiang同tong濃nong度du組zu份fen化hua合he物wu，為wei了le增zeng加jia樣yang品pin容rong量liang就jiu必bi須xu使shi用yong內nei徑jing大da的de柱zhu子zi，目mu前qian實shi驗yan室shi使shi用yong最zui常chang見jian的de柱zhu子zi內nei徑jing一yi般ban是shi4.6mm。
一般選擇原則：分析大分子量化合物選擇大孔徑色譜柱；對於高pH值或者堿性化合物需要選擇高封端或者特殊封端的色譜柱，以改善峰形，延長色譜柱使用壽命等。
xianzaishangpinhuadeyexiangsepuzhulinlangmanmu，genjusepuzhudecanshukeyigeiwomentigongyigechubudexuanze，danyouyugegeyiqichangshangdetianliaojishuhejianhejishudouyouchayi，jishidoushiC18柱，同一品牌不同係列都有不同的功能，有能耐受低pH值的、有耐高溫的、有(you)適(shi)合(he)堿(jian)性(xing)樣(yang)品(pin)的(de)等(deng)等(deng)。所(suo)以(yi)在(zai)選(xuan)擇(ze)色(se)譜(pu)柱(zhu)前(qian)要(yao)好(hao)好(hao)研(yan)究(jiu)色(se)譜(pu)柱(zhu)參(can)數(shu)，仔(zai)細(xi)閱(yue)讀(du)色(se)譜(pu)柱(zhu)說(shuo)明(ming)書(shu)，才(cai)能(neng)找(zhao)到(dao)合(he)適(shi)的(de)色(se)譜(pu)柱(zhu)和(he)適(shi)宜(yi)的(de)分(fen)離(li)方(fang)法(fa)。
