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在zai各ge種zhong水shui體ti，特te別bie是shi汙wu染ran水shui體ti中zhong存cun在zai有you大da量liang的de有you機ji物wu質zhi，適shi於yu各ge種zhong微wei生sheng物wu的de生sheng長chang，因yin此ci水shui體ti是shi僅jin次ci於yu土tu壤rang的de第di二er種zhong微wei生sheng物wu天tian然ran培pei養yang基ji。水shui體ti中zhong的de微wei生sheng物wu主zhu要yao來lai源yuan於yu土tu壤rang，以yi及ji人ren類lei的de動dong物wu的de排pai泄xie物wu及ji汙wu染ran。水shui體ti中zhong微wei生sheng物wu的de數shu量liang和he種zhong類lei受shou各ge種zhong環huan境jing條tiao件jian的de製zhi約yue。
一yi般ban認ren為wei，水shui中zhong微wei生sheng物wu以yi革ge蘭lan氏shi陰yin性xing杆gan菌jun占zhan有you較jiao大da優you勢shi。與yu其qi他ta水shui體ti相xiang比bi，河he水shui及ji溪xi水shui中zhong革ge蘭lan氏shi陽yang性xing菌jun相xiang對dui較jiao多duo，這zhe是shi因yin為wei陸lu地di微wei生sheng物wu衝chong洗xi汙wu染ran的de緣yuan故gu。
shuitizhongdezhibingxingweishengwuyibanbingbushishuizhongyuanyouweishengwu，dabufenshicongwaijiehuanjingwuranerlai，tebieshirenheqitawenxuedongwudefenbianwuran。shuizhongchangjiandezhibingxingxijunzhuyaobaokuo：誌賀氏菌、沙門氏菌、大腸杆菌、小腸結炎耶爾森氏菌、霍亂弧菌、副溶血性弧菌等。
在zai實shi際ji控kong製zhi中zhong，對dui水shui質zhi衛wei生sheng質zhi量liang的de評ping價jia和he控kong製zhi，是shi無wu法fa對dui各ge種zhong可ke能neng存cun在zai的de致zhi病bing微wei生sheng物wu一yi一yi進jin行xing檢jian測ce，而er一yi般ban利li用yong對dui指zhi示shi菌jun的de檢jian測ce和he控kong製zhi，來lai了le解jie水shui體ti是shi否fou受shou到dao過guo人ren畜chu糞fen便bian的de汙wu染ran，是shi否fou有you腸chang道dao病bing原yuan微wei生sheng物wu存cun在zai的de可ke能neng，從cong而er評ping價jia水shui的de質zhi量liang，以yi保bao證zheng水shui質zhi的de衛wei生sheng安an全quan。
目前，世界各國一般認為大腸菌群是指示水質受糞便汙染較好的指示菌。
我國水質控製也采用大腸菌群作為指示菌，GB5749-2006《中華人民共和國國家標準 生活飲用水衛生標準》規定，生活飲用水中大腸菌群不得檢出。
在zai某mou些xie情qing況kuang下xia，水shui體ti中zhong的de細xi菌jun總zong數shu也ye可ke指zhi示shi水shui體ti受shou糞fen便bian等deng汙wu染ran物wu汙wu染ran的de情qing況kuang。這zhe裏li的de細xi菌jun總zong數shu其qi實shi是shi指zhi營ying養yang瓊qiong脂zhi培pei養yang後hou形xing成cheng的de菌jun落luo總zong數shu。目mu前qian世shi界jie各ge國guo對dui於yu控kong製zhi飲yin用yong水shui的de衛wei生sheng質zhi量liang，除chu采cai用yong大da腸chang菌jun群qun等deng指zhi標biao外wai，一yi般ban還hai采cai用yong菌jun落luo總zong數shu這zhe個ge指zhi標biao。我wo國guoGB5749-2006《中華人民共和國國家標準 生活飲用水衛生標準》中規定生活飲用水菌落總數每毫升不得超過100個。
GB5750-2006《中華人民共和國國家標準 生活飲用水標準檢驗法》提供了水質中菌落總數和總大腸菌群的檢測方法。
（一）菌落總數的檢測：
國家標準中，菌落總數是指1ml水樣在營養瓊脂培養基中，於36℃±1℃經48h培養後，所生長的菌落總數。
對生活飲用水，直接吸取1ml水樣於平皿中，加入營養瓊脂後混勻，36℃±1℃培養48h，進行計數。
對水源水，根據情況對樣品進行10倍梯度稀釋，選擇適宜稀釋液1ml，加注平皿，營養瓊脂混勻，36℃±1℃培養48h，進行計數。
按照規定格式報告每毫升水中菌落總數。
（二）總大腸菌群的檢測：
國家標準中，利用總大腸菌群作為糞便汙染的指標。總大腸菌群是指一群需氧及兼性厭氧的，36℃±1℃生長時能使乳糖發酵，在24h±2h內(nei)產(chan)酸(suan)產(chan)氣(qi)的(de)革(ge)蘭(lan)氏(shi)陰(yin)性(xing)無(wu)芽(ya)胞(bao)杆(gan)菌(jun)。水(shui)樣(yang)中(zhong)總(zong)大(da)腸(chang)菌(jun)群(qun)數(shu)的(de)含(han)量(liang)，表(biao)明(ming)水(shui)被(bei)糞(fen)便(bian)汙(wu)染(ran)的(de)程(cheng)度(du)，而(er)且(qie)間(jian)接(jie)地(di)表(biao)明(ming)有(you)腸(chang)道(dao)致(zhi)病(bing)菌(jun)存(cun)在(zai)的(de)可(ke)能(neng)。
國家標準提供了多管發酵法及濾膜法檢測總大腸菌群的方法。
多管發酵法檢測總大腸菌群，分為三步：初發酵試驗，平板分離，複發酵證實試驗。初發酵試驗，采用乳糖蛋白腖培養液37℃培養24h，觀(guan)察(cha)產(chan)酸(suan)產(chan)氣(qi)情(qing)況(kuang)。對(dui)陽(yang)性(xing)管(guan)培(pei)養(yang)物(wu)，接(jie)種(zhong)於(yu)品(pin)紅(hong)亞(ya)硫(liu)酸(suan)鈉(na)培(pei)養(yang)基(ji)或(huo)伊(yi)紅(hong)美(mei)藍(lan)培(pei)養(yang)基(ji)，觀(guan)察(cha)菌(jun)落(luo)特(te)征(zheng)，並(bing)進(jin)行(xing)革(ge)蘭(lan)氏(shi)染(ran)色(se)和(he)鏡(jing)檢(jian)。對(dui)典(dian)型(xing)和(he)可(ke)疑(yi)菌(jun)落(luo)，接(jie)種(zhong)於(yu)乳(ru)糖(tang)蛋(dan)白(bai)腖(dong)培(pei)養(yang)液(ye)，進(jin)行(xing)複(fu)發(fa)酵(jiao)證(zheng)實(shi)試(shi)驗(yan)，並(bing)根(gen)據(ju)標(biao)準(zhun)所(suo)附(fu)檢(jian)數(shu)表(biao)報(bao)告(gao)結(jie)果(guo)。
其中，對生活飲用水，初發酵試驗接種水樣總量300ml，即100ml接種2管，10ml接種10管，采用兩個稀釋度，12支發酵管。對水源水，初發酵試驗接種水樣總量55.5ml，即10ml接種5管，1ml接種5管，0.1ml接種10管，共采用三個稀釋度，15支發酵管。兩種接種方法，所用的檢數表是不同的。
濾膜法檢測總大腸菌群，就是利用微孔濾膜，過濾一定量水樣，將水樣中含有的細菌截留在濾膜上，然後將濾膜帖放在選擇性培養基上（如品紅亞硫酸鈉培養基），經培養和證實試驗後，直接計數濾膜上生長的典型大腸菌群菌落，並計算出每升水樣中含有的總大腸菌群數。
1．菌落總數測定中，應選擇合適的稀釋度進行。生活飲用水，國家標準規定每毫升不得超過100個，因此可以直接吸取1毫升到平板進行培養。
2．總大腸菌群的測定方法，由於飲用水和水源水可能的汙染程度不同，因此采用不同的接種量，檢數表也不相同。
3．當接種量超過1毫升時，一般采用多倍濃度培養液。如配製3倍濃縮乳糖蛋白腖培養液50mL，加入100mL水樣後，總體積為150mL，培養液恢複到正常濃度。
4．濾膜法檢測總大腸菌群，一般在檢測較大量低濁度水樣時采用，大量水樣濾過濾膜後，水中所含有的所有細菌均截留在濾膜上。
