API離子源主要給出分子量信息，也可以通過一些條件限製獲得有限的結構信息，它又包括電噴霧電離源（ESI）
、大氣壓化學電離（APCI）以及大氣壓光化學電離源（APPI）
、大氣壓固相分析探針（ASAP）等。ESI的原理是：待(dai)測(ce)物(wu)經(jing)液(ye)相(xiang)分(fen)離(li)
，通(tong)過(guo)毛(mao)細(xi)管(guan)進(jin)入(ru)電(dian)離(li)源(yuan)，被(bei)離(li)子(zi)源(yuan)的(de)高(gao)壓(ya)電(dian)場(chang)電(dian)離(li)
，同(tong)時(shi)在(zai)脫(tuo)溶(rong)劑(ji)氣(qi)和(he)溫(wen)度(du)的(de)共(gong)同(tong)作(zuo)用(yong)下(xia)霧(wu)化(hua)
，最(zui)終(zhong)形(xing)成(cheng)霧(wu)狀(zhuang)的(de)帶(dai)電(dian)液(ye)滴(di)，隨(sui)著(zhe)溶(rong)劑(ji)不(bu)斷(duan)蒸(zheng)發(fa)
，液(ye)滴(di)的(de)體(ti)積(ji)不(bu)斷(duan)變(bian)小(xiao)
，電(dian)荷(he)在(zai)液(ye)滴(di)中(zhong)不(bu)斷(duan)富(fu)集(ji)，最(zui)終(zhong)在(zai)富(fu)集(ji)到(dao)一(yi)定(ding)程(cheng)度(du)時(shi)，發(fa)生(sheng)“庫倫爆炸”，把液滴炸碎，在多次爆炸後，待測物最終被離子化。ESI源適合於離子型和極性分析物，靈敏度高，能給出分子量的信息，是目前最常用的離子源；但是這種離子源一般最大能允許2mL/min的(de)純(chun)水(shui)相(xiang)通(tong)過(guo)，否(fou)則(ze)不(bu)能(neng)夠(gou)很(hen)好(hao)地(di)霧(wu)化(hua)並(bing)去(qu)除(chu)溶(rong)劑(ji)，並(bing)且(qie)如(ru)果(guo)待(dai)測(ce)物(wu)比(bi)較(jiao)複(fu)雜(za)切(qie)液(ye)相(xiang)分(fen)離(li)不(bu)利(li)的(de)情(qing)況(kuang)下(xia)，會(hui)產(chan)生(sheng)離(li)子(zi)抑(yi)製(zhi)，最(zui)終(zhong)降(jiang)低(di)檢(jian)測(ce)靈(ling)敏(min)度(du)。

APCI的原理是：待(dai)測(ce)物(wu)通(tong)過(guo)毛(mao)細(xi)管(guan)噴(pen)霧(wu)來(lai)霧(wu)化(hua)

，同(tong)時(shi)在(zai)高(gao)溫(wen)和(he)脫(tuo)溶(rong)劑(ji)氣(qi)的(de)共(gong)同(tong)作(zuo)用(yong)下(xia)快(kuai)速(su)蒸(zheng)發(fa)溶(rong)劑(ji)，然(ran)後(hou)電(dian)暈(yun)針(zhen)尖(jian)端(duan)高(gao)壓(ya)放(fang)電(dian)
，使(shi)經(jing)過(guo)電(dian)暈(yun)針(zhen)的(de)待(dai)測(ce)物(wu)發(fa)生(sheng)電(dian)離(li)。

其優點在於使用方便，耐用性好
，靈敏度高，可以匹配高流速
，適合於非極性至弱極性樣品

，小分子樣品以及抗菌素和堿性藥物等。

其缺點在於有可能發生熱裂解
，有低質量端的化學噪聲大，有限的結構信息。

因此ESI和APCI是互補的。

近年來市場上有廠家將ESI和APCI結合起來，推出ESCI複合離子源
，其優點在於提高工作效率
，能夠一次給出ESI+、ESI-、APCI+和APCI-四種電離方式的離子流圖。其缺點在於要求各電離方式之間的切換速度要求比較短，否則在切換時有可能會造成漏檢。

大氣壓固相分析探針（ASAP）是近年來需求比較大的離子源

，其優點是能夠免除前處理，對於膏狀物、粘度大的物質
、易yi發fa泡pao的de物wu質zhi等deng液ye相xiang不bu易yi分fen離li的de物wu質zhi來lai說shuo，可ke以yi直zhi接jie進jin入ru質zhi譜pu檢jian測ce，避bi免mian經jing過guo液ye相xiang，大da大da提ti高gao了le工gong作zuo效xiao率lv。對dui於yu化hua學xue合he成cheng實shi驗yan來lai說shuo，還hai可ke以yi接jie近jin實shi時shi監jian測ce反fan應ying過guo程cheng，非fei常chang方fang便bian。

FAB離子化能力強

，適用於強極性
、揮發性低、熱穩定性差和相對分子質量大的樣品
，對非極性樣品靈敏度下降、低質量區以下產生較多幹擾峰。

MALDI的準分子離子峰很強，幾乎沒有碎片離子，可以直接分析蛋白質酶解後多肽混合物
，對樣品中雜質的耐受量較大
，適用於多肽、蛋白質、糖蛋白

、DNA片段、多糖及其他生物技術產品的分析。API源是我們最常用的液質離子源。

而對於氣相質譜（GS/MS）來說，主要有電子轟擊電離源（EI）、化學電離源（CI）和場致電離源（FI）及場解吸電離源（FD）。

EI是利用一定能量的電子與氣相中的樣品分子相互作用（轟擊），使分子失去電子，電離成離子。當分子離子具有的剩餘能量大於其某些化學鍵的鍵能時
，分子離子便發生碎裂
，生成碎片離子。

其優點在於它是非選擇性電離
，隻要樣品能氣化都能夠離子化
，且離子化效率高
、靈敏度高
；能夠提供豐富結構信息，是化合物的指紋譜；有龐大的標準譜庫供檢索。

其缺點在於不適用於難揮發
、熱不穩定的樣品

，而且隻能檢測正離子
，不檢測負離子。CI是shi指zhi引yin入ru一yi定ding的de反fan應ying氣qi進jin入ru離li子zi化hua室shi

，反fan應ying氣qi在zai具ju有you一yi定ding能neng量liang的de電dian子zi流liu的de作zuo用yong下xia電dian離li或huo裂lie解jie，生sheng成cheng的de離li子zi和he反fan應ying氣qi分fen子zi進jin一yi步bu反fan應ying或huo和he樣yang品pin分fen子zi發fa生sheng離li子zi分fen子zi反fan應ying
，通tong過guo質zhi子zi交jiao換huan使shi樣yang品pin分fen子zi電dian離li。

其優點在於可以通過控製反應，根據離子親和力和電負性選擇不用的反應試劑，用於不同化合物的選擇性檢測。

其缺點在於也不適用於難揮發和熱不穩定樣品
，譜圖重複性不如EI圖譜
，而且反應試劑容易形成較高的本底，影響檢測限。

FI和FD是一種軟電離方式，由一個電極和一組聚焦透鏡組成，形成高達幾千伏的強電場，使氣態分子的電子被拉出而電離。

其優點在於幾乎沒有碎片離子

，沒有本底，圖譜很幹淨。

缺點在於僅適用於扇形磁場質譜和飛行時間質譜儀
，四級杆質譜和離子肼質譜都不能配置FI和FD源，而且高壓容易產生放電效應，操作也更難一些。EI源是我們最常見的氣質離子源。