1. 引物:逆轉錄引物主要有3種,包括 Oligo(dT)、Random Primers和基因特異性引物(GSP)。其中Oligo(dT)具有12-20個T堿基,並且與真核生物mRNA的3’Poly A尾配對,可合成全長的cDNA,但僅擴增有polyA尾的mRNA ,對模板質量要求高,較適合克隆實驗。而Random Primers具有6-9個堿基,可隨機識別模板並結合,適合複雜結構和微量模板,但特異性低,小片段多,適合後續qPCR實(shi)驗(yan)。基(ji)因(yin)特(te)異(yi)性(xing)引(yin)物(wu)可(ke)以(yi)識(shi)別(bie)特(te)定(ding)模(mo)板(ban)序(xu)列(lie),具(ju)有(you)特(te)異(yi)性(xing)強(qiang),靈(ling)敏(min)度(du)高(gao)的(de)特(te)點(dian),但(dan)需(xu)合(he)成(cheng)特(te)定(ding)的(de)序(xu)列(lie)。所(suo)以(yi)根(gen)據(ju)不(bu)同(tong)實(shi)驗(yan)需(xu)求(qiu)可(ke)進(jin)行(xing)相(xiang)應(ying)引(yin)物(wu)的(de)選(xuan)擇(ze)。
2. 逆轉錄酶:一種是來自純化的禽成髓細胞瘤病毒(AMV),由兩條肽鏈組成,具有聚合酶活性和很強的RNaseH活性,它最適溫度是42℃,最適pH8.3,在高反應溫度時可消除 mRNA的二級結構對逆轉錄的阻礙,然而高水平的RNaseH的活性既抑製cDNA產生也限製其長度。另一種來源於鼠白血病病毒(M-MLV),是單肽鏈的,有RNA聚合酶活性和相對較弱的 RNaseH活性,最適溫度37℃,最適pH7.6,較弱的RNaseH活性對獲得2-3kb的mRNA的全長cDNA有很大好處。
3.RNA模板:通常利用紫外分光光度計檢測純度,要求A260/280=1.9~2.1,A260/230=2.0~2.2。利用瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA的完整度,完整的總RNA在進行瓊脂糖凝膠電泳時會產生清晰的28S和18S rRNA條帶(真核樣品),28S rRNA條帶的強度應當大致為18S rRNA條帶的兩倍,並且無gDNA和蛋白殘留。
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