1.劃分操作區:
目前,普通PCR尚不能做到單人單管,實現完全閉管操作,但無論是否能夠達到單人單管,均要求實驗操作在三個不同的區域內進行,PCR的前處理和後處理要在不同的隔離區內進行:
(1)標本處理區,包括擴增摸板的製備。
(2)擴增區,包括反應液的配製和PCR擴增。
(3)產物分析區,凝膠電泳分析,產物拍照及重組克隆的製備。
(4)各工作區要有一定的隔離,操作器材專用,要有一定的方向性。如:標本製備→PCR擴增→產物分析→產物處理。
切記:產物分析區的產物及器材不要拿到其他兩個工作區。
2.分裝試劑:
PCR擴kuo增zeng所suo需xu要yao的de試shi劑ji均jun應ying在zai裝zhuang有you紫zi外wai燈deng的de超chao淨jing工gong作zuo台tai或huo負fu壓ya工gong作zuo台tai配pei製zhi和he分fen裝zhuang。所suo有you的de加jia樣yang器qi和he吸xi頭tou需xu固gu定ding放fang於yu其qi中zhong,不bu能neng用yong來lai吸xi取qu擴kuo增zeng後hou的deDNA和其他來源的DNA:
(1) PCR用水應為高壓的雙蒸水。
(2) 引物和dNTP用高壓的雙蒸水在無PCR擴增產物區配製。
(3)引物和dNTP應分裝儲存,分裝時應標明時間,以備發生汙染時查找原因。
3. 實驗操作注意事項:
盡(jin)管(guan)擴(kuo)增(zeng)序(xu)列(lie)的(de)殘(can)留(liu)汙(wu)染(ran)大(da)部(bu)分(fen)是(shi)假(jia)陽(yang)性(xing)反(fan)應(ying)的(de)原(yuan)因(yin),樣(yang)品(pin)間(jian)的(de)交(jiao)叉(cha)汙(wu)染(ran)也(ye)是(shi)原(yuan)因(yin)之(zhi)一(yi)。因(yin)此(ci),不(bu)僅(jin)要(yao)在(zai)進(jin)行(xing)擴(kuo)增(zeng)反(fan)應(ying)是(shi)謹(jin)慎(shen)認(ren)真(zhen),在(zai)樣(yang)品(pin)的(de)收(shou)集(ji)、抽提和擴增的所有環節都應該注意:
(1)戴一次性手套,若不小心濺上反應液,立即更換手套。
(2)使用一次性吸頭,嚴禁與PCR產物分析室的吸頭混用,吸頭不要長時間暴露於空氣中,避免氣溶膠的汙染。
(3)避bi免mian反fan應ying液ye飛fei濺jian,打da開kai反fan應ying管guan時shi為wei避bi免mian此ci種zhong情qing況kuang,開kai蓋gai前qian稍shao離li心xin收shou集ji液ye體ti於yu管guan底di。若ruo不bu小xiao心xin濺jian到dao手shou套tao或huo桌zhuo麵mian上shang,應ying立li刻ke更geng換huan手shou套tao並bing用yong稀xi酸suan擦ca拭shi桌zhuo麵mian。
(4)操作多份樣品時,製備反應混合液,先將dNTP、緩衝液、引物和酶混合好,然後分裝,這樣即可以減少操作,避免汙染,又可以增加反應的精確度。
(5)最後加入反應模板,加入後蓋緊反應管。
(6)操作時設立陰陽性對照和空白對照,即可驗證PCR反應的可靠性,又可以協助判斷擴增係統的可信性。
(7)盡可能用可替換或可高壓處理的加樣器,由於加樣器最容易受產物氣溶膠或標本DNA的汙染,最好使用可替換或高壓處理的加樣器。如沒有這種特殊的加樣器,至少PCR操作過程中加樣器應該專用,不能交叉使用,尤其是PCR產物分析所用加樣器不能拿到其它兩個區。
(8)重複實驗,驗證結果,慎下結論。
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