1.非特異性擴增帶

PCR擴增後出現的條帶與預計的大小不一致，或大或小，或者同時出現特異性擴增帶與非特異性擴增帶。非特異性條帶的出現
，其原因：

一是引物與靶序列不完全互補、或引物聚合形成二聚體。

二是Mg²⁺離子濃度過高
、退火溫度過低
，及PCRxunhuancishuguoduoyouguan。qicishimeidezhiheliang，wangwangyixielaiyuandemeiyichuxianfeiteyitiaodaierlingyilaiyuandemeizebuchuxian，meiliangguoduoyoushiyehuichuxianfeiteyixingkuozeng。

其對策有：必bi要yao時shi重zhong新xin設she計ji引yin物wu。減jian低di酶mei量liang或huo調tiao換huan另ling一yi來lai源yuan的de酶mei。降jiang低di引yin物wu量liang，適shi當dang增zeng加jia模mo板ban量liang，減jian少shao循xun環huan次ci數shu。適shi當dang提ti高gao退tui火huo溫wen度du或huo采cai用yong二er溫wen度du點dian法fa(93℃變性，65℃左右退火與延伸)。

2.片狀拖帶或塗抹帶

PCR擴增有時出現塗抹帶或片狀帶或地毯樣帶。

其原因往往由於

（1）酶量過多或酶的質量差

（2）dNTP濃度過高

（3）Mg²⁺濃度過高

（4）退火溫度過低

（5）循環次數過多

其對策有：

（1）減少酶量，或調換另一來源的酶

（2）減少dNTP的濃度

（3）適當降低Mg²⁺濃度

（4）增加模板量

（5）減少循環次數