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2．相差顯微鏡（phasecontrastmicroscope）是(shi)用(yong)於(yu)觀(guan)察(cha)組(zu)織(zhi)培(pei)養(yang)中(zhong)活(huo)細(xi)胞(bao)形(xing)態(tai)結(jie)構(gou)的(de)。活(huo)細(xi)胞(bao)無(wu)色(se)透(tou)明(ming)，一(yi)般(ban)光(guang)鏡(jing)下(xia)不(bu)易(yi)分(fen)辨(bian)細(xi)胞(bao)輪(lun)廓(kuo)及(ji)其(qi)結(jie)構(gou)。相(xiang)差(cha)顯(xian)微(wei)鏡(jing)的(de)特(te)點(dian)是(shi)將(jiang)活(huo)細(xi)胞(bao)不(bu)同(tong)厚(hou)度(du)及(ji)細(xi)胞(bao)內(nei)各(ge)種(zhong)結(jie)構(gou)對(dui)光(guang)產(chan)生(sheng)的(de)不(bu)同(tong)折(zhe)射(she)作(zuo)用(yong)，轉(zhuan)換(huan)為(wei)光(guang)密(mi)度(du)差(cha)異(yi)（明暗差），使鏡下結構反差明顯，影像清楚。組織培養研究常用的是倒置相差顯微鏡（invertedphasecontrastmicroscope），它的光源和聚光器在載物台的上方，物鏡在載物台的下方，便於觀察貼附在培養器皿底壁上的活細胞。
3．暗視野顯微鏡（dark-fieldmicroscope）主zhu要yao用yong於yu觀guan察cha因yin反fan差cha或huo分fen辨bian力li不bu足zu的de微wei小xiao顆ke粒li。此ci種zhong顯xian微wei鏡jing主zhu要yao是shi有you一yi個ge暗an視shi野ye集ji光guang器qi，使shi光guang線xian不bu直zhi接jie進jin入ru物wu境jing，故gu呈cheng暗an視shi野ye。而er標biao本ben內nei的de小xiao顆ke粒li產chan生sheng的de衍yan射she光guang或huo散san射she光guang進jin入ru物wu鏡jing，暗an視shi野ye中zhong的de顆ke粒li呈cheng明ming亮liang小xiao點dian，如ru同tong在zai暗an室shi可ke見jian一yi束shu光guang線xian中zhong的de微wei小xiao塵chen粒li一yi般ban。普pu通tong通tong光guang鏡jing最zui大da分fen辨bian率lv為wei0.2μm，暗視野顯微鏡則可分辨0.004～0.2μm的微粒，適用於觀察細胞內線粒體運動及標本中細菌等微粒的運動等。
4．共集激光掃描顯微鏡（confocallaserscanningmicroscope,CLSM）是近10年研製成的高光敏度、高分辨率的新型儀器。它以激光為光源，光束經聚焦後落在樣品（組織厚片或細胞）不同深度的微小一點，並作移動掃描，通過電信號彩色顯像，經過微機圖像分析係統進行二維和三維分析處理。CLSM可對細胞進行三維結構圖像分析，細胞內各種熒光標記物的微量分析，細胞內Ca2+、pH值等的動態分析測定，細胞的受體移動、膜電位變化、酶活性和物質轉運的測定，並以激光對細胞及其染色體進行切割、分離、篩選和克隆。因此，CLSM是一種高技術產品，可對細胞的多種功能進行全自動、高效、快速的微量定性和定量測定。
其他如偏光顯微鏡用於研究組織晶體物質及纖維等的光學性質，紫外光顯微鏡用於研究細胞內核酸的分布與定量等。
