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一、選購生物菌肥時，要注意其是否過了產品保質期，一般超過生產日期1niandeshengwujunfeihuoxinghuixianzhujiangdi。zaikanyouwunongyebudengjizheng，zhengguidechangjiashengchandechanpindouyounongyebudengjidezhengming。haiyaokanbaozhuangdaishangbiaomingdehuojunshuliangshifoufuheguojiaguiding（國家規定生物菌劑有效活菌數≥2億/克，顆粒狀的≥1億/克，複合微生物肥料和生物有機肥有效活菌數≥2000萬/克）。不合格的生物菌肥絕不購買。
二、生sheng物wu菌jun肥fei可ke以yi單dan獨du使shi用yong，但dan最zui好hao是shi與yu經jing過guo充chong分fen腐fu熟shu的de有you機ji肥fei混hun合he使shi用yong，其qi效xiao果guo要yao遠yuan好hao於yu單dan獨du施shi用yong有you機ji肥fei或huo生sheng物wu菌jun肥fei。生sheng物wu菌jun肥fei不bu宜yi與yu化hua肥fei直zhi接jie混hun合he使shi用yong，高gao濃nong度du的de化hua學xue物wu質zhi對dui生sheng物wu菌jun肥fei裏li的de微wei生sheng物wu有you毒du害hai作zuo用yong，尤you其qi要yao注zhu意yi不bu應ying將jiang菌jun肥fei與yu含han硫liu的de化hua肥fei（如硫酸鉀等）及草灰混合用，因為這樣的肥料更容易殺死菌肥裏的有益菌。
三、在對溫室大棚裏的土壤或蔬菜育苗用營養土消毒後，至少要經過10-15天，才可以施用生物菌肥，切記不可施用生物菌肥後再實行土壤消毒。不應同時使用菌肥與殺菌劑、殺蟲劑、除草劑。一般先施菌肥，隔48小時後，再打藥除草。若拌種，切忌和已拌好殺菌劑的種子混合使用。
四、生物菌肥的使用效果和土壤的情況有關。土壤太旱或太濕都不利於生物菌肥效力的發揮，適宜的土壤濕度為60%左右。如果在水田使用，最好於清晨或傍晚采用噴施的方法。
五、生物菌肥對陽光中的紫外線十分敏感。存放或使用時盡量避免強光直接照射，因此生產上一般不采用地表撒施，可以在陰天或清晨、傍晚於土壤中施用。噴霧時隻要在植物的葉片背麵均勻噴布即可。
六、生物菌肥可以單獨施用，但是不能完全代替化肥或有機肥，事實是與後兩者混合使用的效果要好於它們的單獨使用。
七、生物菌肥施入土壤後有一個菌群繁殖、壯大的過程。因此，要先於作物需肥期10-15天施用，此後生物菌肥可以長期、均勻、持續地供給作物養分。
