生sheng物wu樣yang品pin往wang往wang是shi非fei常chang複fu雜za的de生sheng物wu分fen子zi混hun合he體ti，除chu少shao數shu特te殊shu樣yang品pin外wai，一yi般ban不bu能neng直zhi接jie與yu芯xin片pian反fan應ying，必bi須xu將jiang樣yang品pin進jin行xing生sheng物wu處chu理li。從cong血xue液ye或huo活huo組zu織zhi中zhong獲huo取qu的deDNA/mRNA樣yang品pin在zai標biao記ji成cheng為wei探tan針zhen以yi前qian必bi須xu擴kuo增zeng以yi提ti高gao閱yue讀du靈ling敏min度du，但dan這zhe一yi過guo程cheng操cao作zuo起qi來lai卻que有you一yi定ding的de難nan度du。比bi如ru在zai一yi個ge癌ai細xi胞bao中zhong有you成cheng千qian上shang萬wan個ge正zheng常chang基ji因yin的de幹gan擾rao，雜za合he癌ai基ji因yin的de檢jian測ce和he對dui它ta的de高gao效xiao、特異地擴增就不是一件容易的事。因為在一般溶液中PCR擴增時，靶片段太少且不易被凝膠分離，故存在其它不同的DNA片段與其競爭引物的情況。美國Mosaic Technology公司發展了一種固相PCR係統。此係統包含兩套引物，每套都可以從靶基因兩頭延伸。當引物和DNA樣品及PCR試劑相混時，如果樣品包含靶序列，DNA就從引物兩頭開始合成，並在引物之間形成雙鏈DNA環或"橋"。由於上述反應在固相中產生，因而避免了引物競爭現象，並可減少殘留物汙染和重複引發。
根據樣品來源、基因含量、檢測方法和分析目的不同，采用的基因分離、擴增及標記方法各異。為了獲得基因的雜交信號必須對目的基因進行標記。標記方法有熒光標記法、生物素標記法、同位素標記法等。目前采用的最普遍的熒光標記方法與傳統方法如體外轉錄、PCR、逆轉錄等原理上並無多大差異，隻是采用的熒光素種類更多，這可以滿足不同來源樣品的平行分析。
樣品製備的常用試劑：對於檢測表達的芯片，樣品製備通常涉及（m）RNA的純化，cDNA的合成，體外轉錄或者PCR，標記等步驟。而對於SNP或者突變檢測，則往往涉及Genomic DNA純化和PCR、標記等步驟。
1. RNA純化：
從樣品中分離純化高質量的RNA是非常重要的第一步。由於RNA樣品中的DNA碎片會影響後繼的PCR反應，所以要徹底除去樣品中的DNA。通常用mRNA純化的方法可以除去DNA片斷，或者用RNase-Free的DNase處理RNA樣品。在這裏我們介紹一些常用的RNA純化試劑盒，特別是由Affymetrix公司推薦的QIAGEN RNA純化係列。
* RNeasy Protect Kit：
一旦生物樣品被收集分離，它的RNA會立刻變得非常不穩定，極易被降解。由於特異及非特異的RNA降解，或者由於應激反應產生新的RNA都會引起RNA狀態的改變。對於生物芯片、基因表達矩陣分析（Array Analysis）、定量RT-PCR等實驗來說，采樣後立即穩定樣品裏的RNA以保存當時RNA的表達狀態，是精確/定量研究基因表達分析的重要前提。為了達到這個目的，往往需要將液氮或者幹冰帶到采樣現場，采樣後立即抽提RNA或者運回實驗室保存。對於實驗者來說非常不方便。
著名的QIAGEN公司最近新推出一種RNA抽提試劑：RNeasy Protect Kit，提供一整套RNA保護和分離試劑，從樣品的製備到RNA的抽提，隻需一個試劑盒即可解決所有問題。保證樣品的表達信息不受破壞，確保得到可信的基因表達分析結果。
試劑盒裏提供一種RNAlater RNA Stabilization Reagent，隻要在采樣後立即將新鮮樣品浸入這種液體試劑，RNA保護劑可以迅速滲透到組織或其他生物樣本中，穩定並保護RNA完整而不被降解，確保下遊分析得到的數據真實反應樣品的表達信息。保存在RNAlater中的樣品RNA可以在37度下穩定保存1天，或者在18-25度保存7天，2-8度穩定4周，或者在-20度永久保存。這種技術為在不同溫度下采樣，運輸和保存樣品提供了極大的方便，特別適用於各種動物組織、培養細胞、細菌、白細胞，但必須說明的是它不適用於全血或體液中RNA的保存。
RNAlater的用法非常簡單，隻要在采樣後立即將樣品完全浸入適量（10ul/1mg組織）的RNAlater中即可。取樣的動作要盡量快速利索，組織樣品的大小以不超過0.5公分厚為宜，對於一些小的組織如小鼠的脾、腎等器官則可以整個取出浸入溶液中，較大的則應切開為厚度小於0.5公分的小塊，以確保RNAlater 能迅速擴散滲透入組織塊中的所有細胞中。采樣的容器應該足夠大以容納10beiyuzuzhizhongliangderongye，bimianzuzhikuaijizaiyiqi，tongshijianyijiangrongyejiamanrongqiyibimianzaiyunshuguochengzhongzuzhikuailuchuyemian。zhuyibenshijizhishiyongyuxinxianyangpin，duiyulengzanghebaomaideyangpinzhijiechoutiRNA即可。另外對於RNA已經降解的樣品，RNAlater隻能保護剩下的樣品RNA，不能修複已破壞的RNA。
保存後的樣品可以直接用於RNA或者mRNA的抽提。RNAlater不會影響組織塊的結構，可以在室溫下切出適量的組織塊用於稱量和抽提RNA，剩下的部分可用於繼續保存樣品。-20度凍存的樣品可以取出在室溫下進行稱量等操作而無需幹冰。在-20度凍存的樣品反複凍融20次RNA依然保持完好無損。RNAlater處理的樣品比新鮮組織稍微硬一點，但不會影響勻漿過程。取出適量的樣品即可開始加RLT緩衝液進行勻漿化。
和傳統的RNeasy Kit一樣，RNeasy Protect Kits采用QIAGEN著名的矽膠膜純化柱技術，迅速特異地吸附樣品裂解液中的RNA，無需酚氯仿抽提，不用乙醇沉澱或LiCl沉澱，也不用CsCl超離，隻要洗脫即可得到純的RNA。通常情況下RNeasy的純化技術足以除去絕大部分的DNA，而無需額外進行DNaes處理，但是對於一些對痕量DNA非常敏感的實驗，用RNase-Free DNase Set（QIAGEN cat.no. 79254）可以直接在純化柱上消化DNA殘留，在隨後的洗滌步驟中除去DNase，最後洗脫得到不含DNA的純RNA。
試劑盒具有以下優點：
·迅速穩定並保護RNA，確保基因完整、基因表達信息可靠。
·由於RNA Stabilization試劑，您可以放心地在室溫下操作，方便、安全--無須液氮和幹冰。
·確保RNA不受降解--即使多次凍溶也不受影響。
·簡單、快速和可靠RNA分離--使用於所有下遊分析的即用型RNA。
貨號 品名（規格） 價格（RMB）
74124 RNeasy Protect Mini Kit(50) 3181.00
75152 RNeasy Protect Midi Kit(10) 1313.00
75182 RNeasy Protect Maxi Kit(12) 4140.00
76104 RNAlater RNA Stabilizationeagent 682.00
* QIAGEN RNeasy Total RNA純化係列（Affymetrix推薦！）
采用QIAGEN著名的矽膠膜純化柱技術，迅速特異地吸附樣品裂解液中的RNA，無需酚氯仿抽提，不用乙醇沉澱或LiCl沉澱，也不用CsCl超離，隻要20分鍾（Mini Kit）到1小時（Maxi Kit）即可直接從樣品中提取高質量的Total RNA。以下是部分產品信息，更大的包裝信息或者詳細操作手冊歡迎致電基因有限公司或者點擊產品名稱查看。
貨號 品名（規格） 價格（RMB）
74104 RNeasy Mini Kit (50)
75142 RNeasy Midi Kit (10)*
75162 RNeasy Maxi Kit (12)*
74903 RNeasy Plant Mini Kit (20)
* QIAGEN Oligotex Direct mRNA純化係列 （Affymetrix推薦！）
Direct係列產品無需酚氯仿抽提，不用乙醇沉澱或LiCl沉澱，也不用CsCl超離，不到30分鍾可直接從樣品中純化出高質量的mRNA，可用於各種常規應用以及芯片分析，顯微注射，建庫，消減雜交，SAGE技術等要求很高的的實驗。回收率高達90%以上。以下是部分產品信息，更大的包裝信息或者詳細操作手冊歡迎致電基因有限公司或者 到生物通商城查詢。
貨號 品名（規格） 價格（RMB）
72012 Oligotex Direct mRNA Micro Kit
72022 Oligotex Direct mRNA Mini Kit
72041 Oligotex Direct mRNA Midi/Maxi Kit
70022 Oligotex mRNA Mini Kit
70042 Oligotex mRNA Midi Kit
70061 Oligotex mRNA Maxi Kit
* QIAamp RNA Blood Mini Kit
專為從新鮮全血中快速提取高質量的RNA而設計，專利設計的QIAshredder和QIAamp離心純化柱讓你徹底擺脫酚氯仿抽提和離心沉澱的苦惱，簡便快速地純化出適用於各種用途的優質RNA。 QIAamp Viral RNA Mini Kit則適用於從各種無細胞的體液、血清、尿液、CSF中分離RNA，回收率高達90%以上。
貨號 品名（規格） 價格（RMB）
52304 QIAamp RNA Blood Mini Kit(50)
52904 QIAamp Viral RNA Mini Kit (50)
* Clontech公司的Atlas Glass Total RNA Isolation Kit是專為Clontech公司的Atlas Glass
Microarray設計的RNA純化試劑盒。由於Clontech公司認為離心柱式的RNA純化係統純化的樣品RNA在製備探針會在Atlas Glass Microarray上有較高的背景，因而特別設計用硫氰酸胍/酚抽提製備適用於Atlas Glass Microarray樣品RNA以便進行下一步的熒光/同位素標記。
2. Genomic DNA的分離純化：
對於Genotyping、SNP分析和Genomic Chip來說，要檢測基因組或者染色體上的突變就需要製備樣品的基因組DNA而非RNA以進行檢測。在這裏簡單介紹幾個常用的試劑盒，有關詳細資料和操作手冊歡迎致電基因有限公司或到生物通商城查詢。
* QIAamp System（Affymetrix推薦！）
QIAGEN公司專利的樣品純化技術方便快速從多種臨床樣品中純化高質量的Genomic DNA，無需酚氯仿抽提和乙醇沉澱。根據不同的樣品來源可以選擇特定的試劑盒。
貨號 品名（規格） 價格（RMB）
51104 QIAamp DNA Blood Mini Kit(50)
51183 QIAamp DNA Blood Midi Kit(20)
51192 QIAamp DNA Blood Maxi Kit(10)
51304 QIAamp DNA Mini Kit(50)
51504 QIAamp DNA Stool Mini Kit(50)
DNeasy System 是QIAGEN公司為除臨床樣本以外的其他樣本，如動物組織、血液、酵母、細菌、植物等快速製備基因組DNA而設計的，采用矽膠膜技術，無需酚氯仿抽提和乙醇沉澱。單個離心柱或96孔純化板滿足不同的需求。 歡迎直接到生物通商城查詢更多有關產品的信息.
貨號 品名（規格） 價格（RMB）
69504 DNeasy Tissue Kit(50)
69103 DNeasy Plant Mini Kit(20)
69104 DNeasy Plant Mini Kit(50)
68161 DNeasy Plant Maxi Kit(6)
3. 探針的製備和標記：
對於表達芯片分析，常用的有以下幾種方法製備和標記探針：將純化的樣品RNA通過特定的引物逆轉錄合成單鏈cDNA探針，在合成的過程中摻入標記物；或者先將待測樣品的RNA轉錄合成cDNA，再進一步通過加入標記物進行體外轉錄合成cRNA單鏈探針，又或者將合成的cDNA加標記物和特殊引物進行PCR擴增，製備成標記的雙鏈探針。而對於SNP芯片和突變檢測，則需要將純化的基因組DNA用特定的引物擴增並進行標記。由於不同的DNA Array供應商對於標記有不同的要求，我們在下麵分別介紹。
1）Affymetrix的表達芯片：
要求製備樣品的cRNA探針。為保證製備出足夠的cRNA用於雜交和每一步的樣品分析，Affymetrix公司推薦用1μg以上的mRNA（最少0.2μg以上）或者5μg以上的總RNA開始合成cDNA。以HPLC純的T7-(dT)24 Primer(推薦選用GENSET公司的產品，要求是HPLC純的，PAGE膠純化的引物在這裏不適用)作為逆轉錄引物合成cDNA。由於引物中帶有T7序列，因此合成的cDNA的3'端也帶有T7序列。選用Affymetrix公司提供的Enzo？ BioArray？ HighYield？ RNA Transcript Labeling Kit(Cat.No.900182,10次標記)，通過試劑盒提供的生物素標記的核糖核酸和T7 RNA聚合酶，以體外轉錄（IVT）的方式擴增並標記cRNA探針。試劑盒提供體外轉錄和標記的所有試劑，可以作10個反應。標記好的探針經過隨機片斷化（fragmentation，試劑自行配製）後得到大小約為35-200個堿基大小的RNA片斷即可和芯片進行雜交。
2）Affymetrix公司的Genotyping（如人類SNP圖譜分析芯片）和健康研究芯片：
這一類芯片用於檢測樣品基因組的變異，因而隻需純化基因組DNA，並用配套的Primer進行PCR擴增。HuSNP的配套試劑盒裏還提供標記好的引物。而對應2種健康研究芯片，Affymetrix公司則提供Enzo？ BioArray？ Terminal Labeling Kit進行末端熒光標記。
3） Clontech公司的Atlas Pure Total RNA Labeling System：
這是一個從Total RNA中製備同位素標記的cDNA探針的試劑盒。利用生物素偶聯的Oligo（dT）和磁珠偶聯的Streptavidin將mRNA吸附到磁珠上，加入MacroArray（包括尼龍膜基質和塑料基質）提供的基因特異引物混合物（CDS Primer）、同位素標記物和逆轉錄酶，直接在磁珠上合成同位素標記的cDNA探針，最後從磁珠上洗脫標記好的探針，純化後即可用於雜交。這個標記試劑盒可以從少至10μg的total RNA中製備適用於Clontech公司各種尼龍膜基質和塑料基質MacroArray的高質量cDNA探針。由於將mRNA純化和cDNA探針合成、標記合為一體，方便用戶的同時還可節約成本。這個係統不適用於玻片芯片的探針標記。
4） Clontech公司的SpotLight Chemiluminescent System
這種專為Clontech公司各種尼龍膜基質的Macroarray設計的化學發光試劑盒助你徹底從同位素中解放出來，讓你輕鬆快速、高靈敏度地進行各種尼龍膜基質的雜交印跡和MacroArray的非放射性檢測。兩種標記試劑盒（Atlas SpotLight Labeling Kit和SpotLight Random Primer Labeling Kit）適應不同的研究需要，配合通用的雜交檢測試劑盒（SpotLight Chemiluminescent Hybridization & Detection Kit），即可組合出完整的非放射性檢測分析係統。不過這個係統不適用於玻片基質的芯片的探針標記。
由於Atlas係列的DNA微陣列膜上每個點的核酸量有限，所以對標記探針的靈敏度要求非常高，一般情況下同位素是首選。如今Atlas SpotLight標記試劑盒特別提供逆轉錄所需的試劑，可以將2μg以上的mRNA或者50μg以上的RNA樣品製備成生物素標記的單鏈cDNA探針，由於沒有競爭性抑製，單鏈探針的靈敏度要大大高於雙鏈探針。另外生物素標記的探針比32P標記的探針要穩定，可以在半年內多次重複使用。
對於Southern、Northern和多組織Northern預製雜交膜（MTN）、多組織表達矩陣（MTE）等以尼龍膜為基質的雜交、印跡反應，可以選用SpotLight隨機引物標記試劑盒進行標記，和同位素標記一樣簡單，但卻更加安全、容易處理，而且生物素標記的探針穩定時間更長。
配套通用的雜交檢測試劑盒裏提供特殊配方的SpotHyb雜交液，能有效降低背景，減少非特異雜交，提高靈敏度。HRP偶聯的Streptavidin能高效專一地結合生物素標的探針。采用了加強型的化學發光試劑，信號強且發光信號可以持續6小時之久，通常壓片5-10分鍾，一旦結果不理想，允許反複壓片。相比同位素需要壓片過夜，SpotLight讓你當天就得到實驗結果，可謂安全、方便、快速多了；而相比常規化學顯色法，SpotlLight化學發光法的靈敏度要高的多，信號更清晰、幹淨，而且不會出現一旦顯色過度就不可逆轉的毛病。
5) Clontech Atlas Glass Fluorescent Labeling Kit
這是一個間接熒光探針標記試劑盒，標記好的熒光探針適用於各種玻片基質的DNA芯片。在試劑盒提供的dNTP Mix中以氨基化的dUTP（Aminoallyl-dUTP）代替普通的dUTP（這種修飾不影響合成效率），加入2μg以上的樣品mRNA或者20μg以上的total RNA，以及基因特異性引物（一般由芯片試劑盒提供）和逆轉錄酶，合成氨基修飾的cDNA。這時隻要加入N-羥琥珀酰亞胺（N-hydroxysuccinimide）活化的熒光染料（自備）進行偶聯反應，熒光染料的活化基團就會和cDNA中的修飾dUTP上的氨基偶聯，從而生成熒光標記的cDNA探針。熒光染料可以是Cy3、Cy5、FITC、fluorescein、Texas red、rhodamine、bodipy或者Alexa dye，而(er)且(qie)各(ge)種(zhong)熒(ying)光(guang)染(ran)料(liao)的(de)標(biao)記(ji)效(xiao)率(lv)相(xiang)當(dang)。值(zhi)得(de)一(yi)提(ti)的(de)是(shi)這(zhe)種(zhong)間(jian)接(jie)熒(ying)光(guang)標(biao)記(ji)比(bi)直(zhi)接(jie)標(biao)記(ji)法(fa)的(de)效(xiao)率(lv)更(geng)高(gao)，在(zai)雙(shuang)色(se)熒(ying)光(guang)標(biao)記(ji)時(shi)，可(ke)以(yi)避(bi)免(mian)直(zhi)標(biao)法(fa)因(yin)為(wei)Cy5標記效率低而導致Cy3、Cy5兩種顏色信號強度不同的現象。試劑盒提供除熒光染料外的全部試劑，足夠作10次標記。
6）Vysis公司的Microarray Nick Translation Kit是配合Vysis公司的Genomic Microarray--AmpliOnc I Microarray的熒光標記試劑盒，采用缺口平移的方法將熒光標記的dUTP摻入純化的樣品基因組DNA中作為探針，和AmpliOnc I Microarray進行雜交。
除了廠家為自家的DNA Array提供的配套核酸純化和標記試劑盒,我們還介紹幾個比較有特色的同類產品：
4．用於多次反複雜交的可洗脫探針製備技術：
Ambion公司的Strip-EZ RT Kit是專門為尼龍膜基質的Macroarray，以及各種預製雜交膜而設計的cDNA探針合成標記試劑盒。我們在前麵介紹過尼龍膜基質或者塑料基質的Macroarray的de優you點dian之zhi一yi是shi在zai雜za交jiao檢jian測ce後hou可ke以yi將jiang膜mo上shang結jie合he的de探tan針zhen洗xi脫tuo，因yin而er膜mo可ke以yi重zhong複fu使shi用yong多duo次ci，能neng夠gou一yi定ding程cheng度du的de降jiang低di每mei一yi次ci的de使shi用yong成cheng本ben。常chang規gui的de膜mo再zai生sheng方fang法fa需xu將jiang膜mo放fang在zaiSDS溶液中煮沸一定時間，因而會對膜和膜上的信號造成損耗，通常重複使用3次後已經得不到清晰的信號。
Strip-EZ RT試劑盒的工作原理是在逆轉錄酶合成cDNA探針的同時摻入經修飾過的脫氧核苷酸（專利技術，這種修飾不會影響探針的雜交特性）和標記核苷酸，合成的探針與膜經過雜交、檢測後將膜浸入Probe Degradation Buffer中5分鍾，修飾過的脫氧核苷酸降解，探針即被降解寡核苷酸碎片，再將膜浸入再生Buffer中68℃下溫和地洗脫降解的寡核苷酸碎片，膜即可再生。Strip-EZ RT Kit製備的cDNA探針可以在非常溫和的條件下（試劑由試劑盒提供）洗脫原有的雜交信號，減輕對膜的傷害，延長膜的使用壽命，降低膜的使用成本。數據表明經過9-15次反複洗脫後的膜依然能得到清晰的雜交信號(見圖，左邊為STRIP-EZ標記探針，右邊為普通探針，膜經過1，3，5，10，15輪反複雜交-洗脫-再雜交後檢測信號）這個試劑盒可用於同位素標記和非放射性標記，需要0.5-1μg以上的mRNA或者10μg以上的total RNA作為起始材料，不過廠家推薦盡可能的使用純化的mRNA，因為使用total RNA會導致較高的非特異背景，影響檢測。
Ambion公司針對不同廠家的Macroarray還推出了優化條件的專用試劑盒Array-Advantage AA Kit （Cat.No. 1857，for Clontech's Atlas Nylon Array)， Array-Advantage GF Kit (Cat.No. 1855, for Research Genetics' GeneFilters Array， Array-Advantage UA Kit （Cat.No.1853, for Ambion's ULTRArray)。除了Strip-EZ RT所需試劑外，這種試劑盒裏還提供探針純化柱（30），可以除去探針中多餘的標記物和雜質，同時還提供適用於尼龍膜的快速雜交液（500ml）、20xSSC（1L）、10%SDS（1L）等試劑和需要用到的指管。對於需要RNA探針或者DNA探針的用戶，Strip EZ還有RNA、DNA和PCR三種不同的試劑盒可供選擇，詳情請致電基因有限公司或訪問生物通商城。
以上各種方法都要求較大量的起始材料（通常要1μg以上的mRNA），對於那些數量很少的樣品該怎麼辦呢？對於細胞數量不少於1000或者質量不少於100μg的樣品，可以選用Clontech公司的SMART PCR cDNA Synthesis Kit（K1052—1）結合Atlas SMART Probe Amplification Kit。SMART技術是利用逆轉錄酶在逆轉錄反應過程中遇到mRNA5’端帽子結構時會自動加若幹個dCTP的特性，在反應體係中加入末端帶若幹個G的SMART Oligonucleotide與之形成匹配，使逆轉錄酶以SMART引物為模板繼續延伸合成的cDNA，從而使合成的cDNA5’端帶上SMART引物的對應序列，就可以直接用PCR進行擴增。因此隻要少至50ng的total RNA就可以通過擴增得到足夠的材料來合成探針。擴增後的cDNA加入基因特異性引物（如果沒有，可以用隨機引物，但會導致背景升高和靈敏度降低）、Klenow酶、SMART Blocking Solution和標記物合成cDNA探針。這個SMART Blocking Solution可以阻斷前麵的SMART引物，避免對後繼的探針合成和雜交產生影響。SMART技術經過優化後可以保證擴增後的cDNA基本保持原始RNA樣品的複雜度和相對豐度，因而合成的探針也保持同樣的代表性。
對於更少的樣品，比如用Laser Capture Nicrodissection激光顯微俘獲係統從組織切片上挑選的少量細胞或者手術切下的較小的組織塊（例如活組織檢查切片），則可以考慮以下方法：用帶有T7序列的Oligo（dT）和特別靈敏的QIAGEN Sensiscript RT Kit（適用於特別少量的RNA樣品，如單細胞RT-PCR）將樣品RNA反轉錄為帶T7序列的cDNA，再用Ambion公司的MEGAscript High Yield Transcription Kit進行體外轉錄，大量擴增mRNA後再用不同的方法製備探針。Ambion公司專利的大規模合成RNA技術可以在較短時間內合成大量RNA，其產量為常規方法的10—50倍，最長可以合成常達16kb的轉錄本，特別適合少量樣品中低豐度的RNA擴增。另外也可以選擇Ambion公司的Cell-to-cDNA試劑盒，則可以避免少量樣品抽提RNA的麻煩，通過細胞裂解、RNAse失活和DNAse消化到cDNA合成，直接合成cDNA，然後再配合MEGAscript High Yield Transcription Kit擴增RNA，最後標記探針。
另外，由於標記後需要去除標記反應中的雜質和未摻入的標記物才能進行雜交，我們在這裏另外介紹幾個純化探針的產品：
QIAGEN公司的QIAquick Nucleotide Removal Kit（Cat.No.28304, 50preps）獨特的矽膠膜技術能夠在5分鍾內純化10μg從17mer—40mer的單鏈DNA或者40bp—10kb的雙鏈DNA，能去除99%以上的<10mer的寡核苷酸或者dNTP。特別適合去除同位素標記反應中的未摻入的標記物。
Ambion公司的NucAway Spin Columns（Cat.No.10070，30preps）一步離心即可有效去除未摻入的標記物和鹽，特別適合探針純化，保證無RNase、DNase汙染。
Clontech公司的CHROMA SPIN olumn（Affymetrix推薦！）是一類預裝微型凝膠過濾柱，用時隻要拆開兩端密封，離心--上樣--離心，即可有效去除樣品中的小分子雜質，3種不同的緩衝液適合不同需要：TE Buffer適合常規的DNA純化，STE（TE 0.1M NaCl）適合需要較高鹽濃度以防止樣品分子間的離子相互作用，而DEPC-H2O（ 0.1M EDTA）適合RNA的純化。每一種緩衝液均有6種不同的型號，根據凝膠孔徑的不同，分離樣品的範圍可從15mer到Genomic DNA。
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產品 |
應用 |
| K1300-1 CHROMA SPIN STE-10 Columns（20） K1320-2 CHROMA SPIN TE-10 Columns（50） |
去除未摻入的核苷酸；去除5 kDa的小分子；核酸反應中脫鹽或換Buffer；純化>15mer的寡核苷酸 |
| K1301-2 CHROMA SPIN STE-30 Columns（50） K1321-2 CHROMA SPIN TE-30 Columns(50) K1331-2 CHROMA SPIN-30 DEPC-H2O Columns(50) |
純化>35mer的DNA或者RNA分子，在標記或合成cDNA反應中除去＜9mer的小分子、鹽和dNTP，去除連接反應中的Linker；純化>30 kDa的蛋白 |
| K1302-1 CHROMA SPIN STE-100 Columns(20) K1322-1 CHROMA SPIN TE-100 Columns(20) K1332-1 CHROMA SPIN-100 DEPC-H2O Columns（20） K1332-2 CHROMA SPIN-100 DEPC-H2O Columns（50） |
純化>140bp的DNA或者140堿基的RNA分子；除去PCR反應後未延伸的Primer或者＜30bp的短擴增產物；在轉錄和DNase消化DNA模板後純化>140mer的RNA探針；除去消化後的瓊脂糖成分；從DNA或者RNA溶液中除去＜250 kDa的蛋白； |
| K1325-2 CHROMA SPIN TE-200 Columns 50 K1335-1 CHROMA SPIN-200 EPC-H2O Columns 20 |
PCR反應後純化>350bp 的DNA分子；除去＜50mer的引物和＜45bp的引物雙體；除去＜1000kDa的蛋白 |
| K1323-2 CHROMA SPIN TE-400 Columns 50 | 純化或者篩選>600bp的DNA分子；從>600bp的PCR產物中除去＜100bp的引物和擴增產物；除去＜8000kDa的蛋白 |
| K1334-1 CHROMA SPIN-1000 DEPC-H2OColumns(20) K1334-2 CHROMA SPIN-1000 DEPC-H2OColumns(50) |
純化>1350bp的DNA分子；純化lambda DNA、酵母基因組DNA和其他大分子；從質粒中去除各種蛋白和RNA；除去＜500bp的cDNA |
另外，有的研究人員習慣用酚氯仿抽提純化核酸，除了對人體有害，酚氯仿抽提的另一個問題是：為wei避bi免mian將jiang中zhong間jian層ceng的de蛋dan白bai雜za質zhi或huo有you機ji相xiang連lian同tong上shang清qing一yi起qi吸xi出chu，往wang往wang需xu要yao棄qi去qu一yi部bu分fen上shang清qing不bu要yao，這zhe種zhong情qing況kuang會hui造zao成cheng相xiang當dang一yi部bu分fen樣yang品pin損sun失shi，特te別bie是shi小xiao體ti積ji的de酚fen抽chou提ti。所suo以yi我wo們men在zai這zhe裏li介jie紹shao一yi個ge新xin產chan品pin，相xiang信xin大da家jia一yi定ding會hui喜xi歡huan：Eppendorf公司的Phase Lock Gel（Affymetrix推薦！）隻要將酚氯仿和樣品的混合物加入預裝有Phase Lock Geldeguanzili，lixin，zhezhongzhuanlidehuahewujiuhuizaishuixiangheyoujixiangzhijianxingchengyicengzhimideguti，jiangzhongjiancengdedanbaizazhihexiacengyoujixiangwanquansuozaigutizhixia，nikeyiqingsongdexichuquanbushuixiangyangpin，tigaohuishoulverbuyongdanxinhunruzazhi，yebuyongdanxinfenlvfanghuibuxiaoxinliuchulai。duiyudatijideyangpinchouti，haikeyizhijiejiangquanbushuixiangdaochueryoujixiangyiranbeilaolao“鎖定”在管底不會流出。Phase Lock Gel不會影響常規的酶反應，你可以在裝有Phase Lock Gel的管子裏進行酶切，加熱失活，再進行酚抽，離心後酚被鎖在固相之下，再直接加入酚氯仿抽提，再離心，Phase Lock Gel會重新在新的水相和有機相之間形成固體，將全部有機溶液鎖在固體層之下，相當方便。Phase Lock Gel分為PLG Heavy和PLG Light兩種，前者適用於堿法提質粒、RNA抽提等雜質較多（粘稠）的情況（不適合純酚抽提），後者適用於酶切反應、cDNA合成、標記反應和常規組織Genomic DNA純化（Mouse tail除外），適用於純酚、酚氯仿、氯仿抽提。
